糖鎖遺伝子リスト

GGDBのトップページは、糖鎖遺伝子のリストを表示しています。
右側に糖鎖遺伝子がアルファベット順に表示されます。 左側にはテキスト検索とファセット検索を用意しています。これらの機能を使って糖鎖遺伝子を絞り込むことができます。

list


テキスト検索

GGDBでは、検索フォームよりテキスト検索を行えます。

search

この検索フォームに任意の文字列を入力すことで、該当する糖鎖遺伝子を絞り込むことができます。
例では、検索フォームに “fut” と入力し、該当した糖鎖遺伝子が絞り込まれています。

search

また、糖鎖構造IDのJCGG-STR(例:JCGG-STR026209)および、GlyTouCan ID (GTCID)(例:G43547MI)を使った絞り込みも可能です。

search

search


ファセット検索

さまざまさ項目から絞り込むことができるファセット検索を設置しています。

faceted

GGDDBでは以下の6種類のファセット検索が可能になっています。

  1. Family
  2. Pathway Class
  3. Keyword
  4. Donor
  5. Expression
  6. Genetic Disease

例えば、Familyの Fucosyltransferase をクリックすると、Fucosyltransferase に関係のある糖鎖遺伝子のリストに絞り込まれます。加えて、Pathway Classの N-glycan をクリックすることで、N-glycan の条件を追加した絞り込みができます。

search

同じグループ内(Familiy内で2つ以上選択)では、OR検索になりますが、別グループ同士(Family + Pathway Class)だと、AND検索になります。 フィルターのリセットは、リストの上にある Reset All Filtersをクリックします。